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在无法获知状况，只能呆呆望着海中的美里的耳边，突然响起了一个熟悉的声音。
“葛城——”
乘坐着垂直起降战斗机——雅克Brave改的，加持良治的身影出现在美里的视野中。
“加持！！”
美里欢喜地期待着事态的进一步发展，可对面传来的声音却显得十分轻松：
“不好意思，我有东西要送，先走一步了——”
随着这声音，雅克Brave就这样向着天空飞走了。
“居然逃走了……”
东治用一副哑然的表情望着天空，小声念道。而在那之前，美里的脸早已经气歪了。
使徒的动作在一瞬间停止了。而在那之后，又仿佛在寻找什么一般，就这么拖着二号机开始到处乱窜起来。
“我们被它拽住了！”
“哼，没问题的啦。”
二号机就这样被使徒拖着向着海底深入。随着一下巨大的冲击，使徒离开了二号机，原来是电缆伸到头了。
“这个位置的话，很理想呢。”
“你打算干什么？”
“好好看着吧。”
澪一边这么说着，二号机左肩上背着的那个棒状物体随之转向了正面。
笔直地对着使徒。
“输出功率63%，连接没有问题。……发射！”
闪光。紧接着是巨大的轰鸣声。
可真嗣却根本不明白发生了什么。
海中好像发生了什么事。随之，海面上掀起巨大的水花。
“发生了什么事？”
就在美里发出惊叫的下一个瞬间，猛烈的海流袭击了太平洋舰队。小型的军舰有的直接被海浪吞没，其他的也互相发生撞击，一艘接一艘地沉入海中。
美里一边奋力地抓住舰桥上的横杆，一边大叫道。
“这到底是什么一回事啊～！！？”
而在海底，二号机也被突然出现的旋涡卷了进去。
“呵——呵—呵—呵—呵，和预想中的威力一样大呢。”
“好像并不是……‘没什么事’那么简单吧？”
“嘛，反正歼灭使徒的目的算是……达成了吧。”
“……在那之前我们能回得去么？”
在插入栓中，澪紧紧地搂住真嗣。
“如果不行了的话……我们就一起死了吧。真嗣君。”
“我才不要呢，救命啊～”
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新横须贺港口。赤木律子前来迎接美里。
舰队中幸存的船舰接连靠岸。
“看样子，打得相当惨烈呢。”
“3分之1是因为使徒，3分之1是由于谜之冲击波而沉没。剩下的3分之1也都残破不堪呢。喂，我说，二号机的那个武器是什么？居然能绕过A.T力场直接把使徒歼灭，这不是比起屋岛作战时的阳电子炮还要高的威力吗？”
律子一边看着资料，一边回答道。
“……我也不太清楚呢。看样子是德国支部那里独自开发出来的武器。”
“这技术也未免太厉害了吧。那里有那么优秀的研究员吗？”
“但是……这份资料，把军舰卷进去的那阵冲击波是……这是，时空震动？……难道说，那武器是天使的背骨？”
“天使的背骨？那是什么？”
“不可能的，那东西不可能研制得出来的啊……”
律子这么说着，惊异地望着面前即将从船上被卸下来的金色机体——二号机。面对几乎从来不会露出如此惊讶表情的律子，美里也什么都说不出来地，用相同的眼神注视着二号机。
“哎呀，可真是波澜万丈的海上旅行呢。不过，用那东西真的不要紧吗？万一那时出了一点点差错，连同你儿子在内，整个太平洋舰队都会全部消失的哦。”
“没办法的事。不过从结果上来看，‘那东西’救了真嗣一命。光从这一点上来看，也算是个收获了。”
“为了测试一下二号机的性能……而这个就是为此而准备的诱饵，是吧？”
“是的。最初的人类——亚当。要把使徒引出来，用这个是最为确实的方法了。”
“人类补完计划的核心部分呢。不过，居然用这种方式使用它，委员会那里想必会无法接受吧？”
“总比直接在这里试用那门大炮要好吧。”
“……原来如此，我表示同意呢。”
然后，在NERV本部的入口处。
一个少女静静地注视着NERV的标志。
“神居于天，天下太平……吗……”
紧接着，少女微微露出笑容。那是像宠物猫一般的微笑。
“总算是……回来了呢……”
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“很久不见了呢……”
“……我和你应该是第一次见面吧。”
“别再卖弄拙劣的演技了，冬月老师。那个人在哪里？”
“这会儿应该在飞机上吧，他去参加国际联合的会议了。”
“……也就是说，他还是和过去一点没变呢。”
“你好像保护了真嗣君嘛。”
“算是吧，毕竟孩子是无罪的啊，而且还挺可爱的呢。”
“和她已经见过面了吗？”
“她？你是指第一适格者？……还是说是……”
“这问题真是愚蠢呢。”
“这会儿还暂时没有主动去见她的打算呢。反正迟早那孩子也会找上门来的吧。”
“……从现在开始你打算干什么？”
“这个嘛……就要看那个人的表现如何了。”
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“喂我说老师，那个女孩子怎么样了？”
现在是一天的课程宣告结束，学生们陆陆续续回去的时间。东治向正在整理背包的真嗣发话了。
“‘那个女孩子是指？”
“哎呀，就是第二适格者，那个叫澪的女孩子啊。”
“对对，我也正想问呢。”
剑介也插话进来。
“她和我们同年的吧？会不会转到我们学校里来啊？”
“…这个嘛……”
“美里小姐什么都没和你说吗？”
“没有……她什么也没说。总感觉美里小姐好像在故意避开和那个女孩子有关的话题呢。”
东治和剑介两人对望了一眼。
“这么一说，她给人的感觉确实有点奇怪呢。”
“一直都称呼美里小姐是‘美里酱——’的嘛，真是个怪人呢，那女孩。”
“不过嘛，EVA的驾驶员如果不是怪人想必也当不成的吧？”
“这算什么嘛。……那再见，今天我要去NERV了。”
“哦，那拜了啊。”
“明天再见。”
真嗣告别两人走出教室，脚步匆匆地向前走去。也许是要显出这样做的价值所在吧，在门口的鞋柜处，果然发现了他想见的那个少女。
“绫波——”
听见真嗣的声音，少女转过头来。一如往常的红色眼眸。她停下自己的动作转而注视着这边，真嗣快步跑了过去。
“绫波，今天是要去NERV吧。一起去好吗？”
听见这句话，红色眼眸的少女——绫波 丽点了点头，等待真嗣换上自己的室外鞋。接着，两人并排着走了出去。
乘坐着轨道列车（即连通第三新东京市与地下空间的列车），两人坐在靠一起的座位上。最近这段时间，两个人一起来NERV的时候，每次都是这样的。由于正好是傍晚时分的中间时刻，车里根本没有其他的乘客。
两人既没有聊天，也没有彼此握着对方的手。只是仿佛互相贴近一般，静静地享受这一段时光。
学校和NERV之间，这段距离决非遥远。而就在这里，有着这么一个能够令两人容身其中的，只属于这两人的空间。
学校也好、使徒也好、甚至连NERV的事都可以暂时忘却，仅仅专心沉浸于感受彼此的存在的，这样一个空间。
然而，这一天却稍微有些不同。平时几乎不会主动发起对话的丽，用仿佛嗫嚅一般的声音向真嗣问道：
“……第二适格者，见过面了吧？”
对这突如其来的问话略微感到惊讶，真嗣望向丽。她会对他人抱有兴趣实在是件稀罕事。感受到真嗣的目光，丽也默默地望向他。
“嗯，不过，绫波还不知道吗？”
“嗯……是个怎样的人？”
该如何回答好呢，真嗣陷入了困惑。
第二适格者，绫波 澪。一个和现在坐在自己身旁的少女拥有同样容貌的人。
在丽表示“不知道”的情况下，总觉得就这样直接把事实告诉她不太好。
红色的眼眸像是要发出射线一般，笔直地盯着自己。
这时，真嗣才察觉到，丽真正在意的并不是澪，而是和澪接触后，却至今没有向她提起过此事的自己。
终于下定决心实话实说。
“她叫……绫波……澪。她和绫波你有着一模一样的……一模一样的脸。”
丽惊讶地睁大了双眸。
“因为姓氏一样，一开始我还以为是不是绫波你的双胞胎姐妹呢。……不过，稍稍相处了一会儿就发现了，这个人是……不一样的。”
“不一样？”
“嗯……澪小姐的眼睛颜色是黄色，光这一点就能很清楚地明白‘是不同的’了。而且她的气质，是一种强烈的不协和感还是什么，我也说不清，但总觉得有哪里很奇怪。”
丽若有所思地听着真嗣的话。
“也许是我总是看着绫波的关系吧，总觉得有什么——说话方式啦，行动啦，有什么地方很不适合——不，用很不符合也许更好——总之就是这样的感觉。……对不起，好像搞得连我自己都不知道自己说了些什么……”
仿佛深陷于自己的思想中一般，丽慢慢地摇了摇头。
“……绫波……澪……和我同样的脸……黄色的眼睛……”
抬起头来，仿佛仰望着虚空中的什么东西，一边缓缓念道。望着她这副沉浸于思考什么东西的样子，真嗣也说不出话来了。